Prodi Doktor PAI UIN Sunan Ampel Surabaya meningkatkan kerjasama antar lembaga perguruan tinggi dengan Asosiasi Pengelola Doktor PAI di seluruh Indonesia. Salah satu bentuk riil kerjasama tersebut adalah mengadakan Webinar di UIN Sunan Kalijaga. Dalam hal ini, Prof. Dr. Abdur Rochman Assegaf, M. Pd dari UIN Sunan Ampel Surabaya menjadi salah satu narsumber dalam webinar tersebut.
