Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam UIN Sunan Ampel Surabaya memiliki 5 (lima) Program Studi, diantaranya

1. Program Studi Ekonomi Syariah
2. Program Studi Manajemen
3. Program Studi Akuntansi
4. Program Studi Ilmu Ekonomi
5. Program Studi Manajemen Zakat dan Wakaf

Untuk melakukan pendaftaran mahasiswa baru, maka calon pendaftar bisa melakukan pendaftaran secara online melalui website Penerimaan Mahasiswa Baru UIN Sunan Ampel Surabaya, dengan alamat website https://pmb.uinsby.ac.id

Berikut beberapa menu yang terdapat di website pmb.uinsby.ac.id adalah sebagai berikut:

1. Pengumuman
2. SNBP
3. SPANPTKIN
4. Mandiri Prestasi
5. Mandiri Reguler
6.  Mandiri Doktor
7. Mandiri Magister
8. Program Khusus