Program Studi Doktor Studi Islam is one of study program berada pada Pascasarjana Universitas Islam Negeri (UIN) Sunan Ampel Surabaya. Lulusan Prodi DSI memiliki kompetensi yang unggul, berdaya saing di level internasional dalam kajian Islam dan sosial keagamaan inter dan multidisipliner. Profil lulusan Prodi DSI mengembangkan dari Body of Knowledge (bangunan keilmuan) yang memuat kajian-kajian tersebut, dan  kajian ilmu-ilmu sosial sebagai penciri khusus. Body of knowledge ini sejalan dengan paradigma Integrated Twin Towers UIN Sunan Ampel Surabaya, yakni integrasi kajian Islam di satu tower dan ilmu-ilmu sosial serta teknologi di tower lain sehingga terbentuk bangunan utuh untuk membangun karakter smart, pious and honourable (cerdas, berbudi luhur, dan bermartabat).