Program Studi Sistem Informasi Universitas Islam Negeri Sunan Ampel Surabaya memiliki fasilitas-fasilitas yang dapat menjamin kegiatan dan proses belajar mahasiswa. Fasilitas-fasilitas yang berada di Program Studi Sistem Informasi Universitas Islam Negeri Sunan Ampel Surabaya yaitu Ruang Kelas, Laboratorium, Ruang Tugas Akhir (Ruang Skripsi), dan Ruang Sidang.
Ruang Kelas
Program Studi Sistem Informasi Universitas Islam Negeri Sunan Ampel Surabaya menyediakan fasilitas sebanyak lima ruang kelas untuk proses pembelajaran di Gedung Terpadu Lantai 7.
Laboratorium
Program Studi Sistem Informasi Universitas Islam Negeri Sunan Ampel Surabaya menyediakan 5 laboratorium untuk praktikum, laboratorium tersebut yaitu
Laboratorium Programming
Laboratorium Basis Data
Laboratorium Sistem Operasi dan Jaringan
Laboratorium Kecerdasan
IT GRC Laboratorium
Ruang Tugas Akhir (Ruang Skripsi)
Ruang Sidang Skripsi
Program Studi Sistem Informasi Universitas Islam Negeri Sunan Ampel Surabaya menyediakan fasilitas ruang sidang skripsi.